Сюжет мультфильма разворачивается вокруг последнего представителя легендарного рода Змеев Горынычей, который, вопреки ожиданиям и семейной традиции, оказывается вовсе не грозным разрушителем, а добродушным и немного неуклюжим существом по имени Горыныч. Его жизнь в уединённой пещере проходит спокойно и размеренно, пока однажды судьба не сталкивает его с маленькой девочкой Аленкой, бесстрашно забравшейся в его владения за цветком папоротника. Эта неожиданная встреча становится началом большой дружбы, ломающей вековые стереотипы. Однако идиллии мешает коварный и честолюбивый царь, который, узнав о существовании дракона, видит в нём лишь средство для укрепления собственной власти и запугивания подданных. Он приказывает поймать Горыныча, что вынуждает безобидного великана и его юную подругу отправиться в опасное путешествие, полное испытаний, чтобы спастись от царской охоты и найти своё место в мире, где дракону совсем не рады. Основная история строится на контрасте между истинной сущностью Горыныча и тем образом кровожадного чудовища, который навязывает ему общество и власть. По мере развития сюжета, путешествие героев превращается не только в бегство, но и в путь самопознания и отстаивания своего права быть другим. Горыныч, Аленка и их верный спутник — говорящий ворон — проходят через густые леса, хитроумные ловушки и встречи с другими сказочными обитателями, постепенно раскрывая главную мысль: истинная сила заключается не в огне и разрушении, а в доброте, верности и способности оставаться собой вопреки обстоятельствам. Финал мультфильма приводит к масштабному, но совершенно нестандартному противостоянию у стен царского дворца, где главному герою предстоит не сражаться, а продемонстрировать свою настоящую природу, совершив невозможное и изменив представления целого королевства о дружбе и храбрости, доказывая, что даже дракон может стать символом мира и спасения.